Per Luì comincia una giornata importantissima; sta infatti per conseguire il diploma di scienziato. Sofì e l'amico Pongo lo sostengono come sempre. Prima della cerimonia però irrompono il Signor S e Perfidia che si vogliono impadronire degli oggetti magici. Uno di questi, la clessidra, si rompe dopo una colluttazione. La polvere che c'era dentro trasporta Sofì e Perfidia nell'Antico Egitto dove dovranno scontrarsi anche con Viperiana, una sacerdotessa che ambisce a diventare Regina e dominare sui suoi sudditi. Luì e il Signor S finiscono invece in un futuro dominato da perfidi robot e saranno costretti a unire le loro forze per scappare. Solo Pongo è rimasto nel presente e fa di tutto per farli tornare a casa.
La coppia di popolarissimi youtuber Luigi Calagna e Sofia Scalia seguitissimi da bambini tra i 4 e i 10 anni che sanno a memoria le loro battute, dopo il successo al box office di La vendetta del Signor S e,de Il mistero della scuola incantata, hanno ormai trovato il format perfetto per il cinema: film di 60 minuti; estensione dell'universo colorato dei loro video su YouTube; un'azione appena accennata dove i cattivi non sono poi in realtà tali e che richiamano l'universo dei Barbapapà.
